Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR1I3Q14994 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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