Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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