Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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