Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.568e-7■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.236e-6■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 ATAD5-202ENST00000578295 4051 ntTSL 1 (best)11.16□□□□□ -0.626e-6■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.554e-10■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.24e-10■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.214e-10■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 PPM1H-204ENST00000551214 862 ntTSL 39.13□□□□□ -0.957e-6■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 PPP2R2D-207ENST00000616467 2058 ntTSL 1 (best)26.18■■□□□ 1.782e-6■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.72e-6■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 PPP2R2D-204ENST00000482010 1792 ntTSL 218.62■□□□□ 0.572e-6■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 PPP2R2D-205ENST00000490777 1462 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.262e-6■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 PPP2R2D-202ENST00000470416 6203 ntTSL 1 (best)12.36□□□□□ -0.432e-6■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 TRAPPC12-217ENST00000473348 491 ntTSL 512.64□□□□□ -0.397e-7■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 TRAPPC12-223ENST00000497597 3401 ntTSL 211.96□□□□□ -0.57e-7■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 TRAPPC12-205ENST00000416918 473 ntTSL 311.7□□□□□ -0.547e-7■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 TRAPPC12-213ENST00000461577 677 ntTSL 210.45□□□□□ -0.747e-7■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 TRAPPC12-221ENST00000489032 561 ntTSL 38.04□□□□□ -1.127e-7■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 TRAPPC12-208ENST00000437733 518 ntTSL 56.66□□□□□ -1.347e-7■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.471e-10■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 LINC01128-211ENST00000610067 550 ntTSL 417.13■□□□□ 0.331e-10■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.261e-10■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.241e-10■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 LINC01128-202ENST00000416570 612 ntTSL 315.9■□□□□ 0.141e-10■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 LINC01128-204ENST00000441765 750 ntTSL 215.11■□□□□ 0.011e-10■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 LINC01128-206ENST00000448975 633 ntTSL 513.63□□□□□ -0.231e-10■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 LINC01128-201ENST00000415295 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.461e-10■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 LINC01128-209ENST00000609009 767 ntTSL 510.52□□□□□ -0.731e-10■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 LINC01128-213ENST00000623070 494 ntTSL 410.36□□□□□ -0.751e-10■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 LINC01128-212ENST00000622921 724 ntTSL 510.36□□□□□ -0.751e-10■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.021e-10■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 LINC01128-214ENST00000623808 493 ntTSL 57.3□□□□□ -1.241e-10■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 LINC01128-215ENST00000624927 677 ntTSL 54.41□□□□□ -1.71e-10■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.882e-31■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 MON2-205ENST00000547095 5708 ntTSL 1 (best)19.3■□□□□ 0.684e-7■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.654e-7■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.594e-7■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.574e-7■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 MON2-212ENST00000552115 3760 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.224e-7■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 MON2-214ENST00000641654 10382 ntBASIC12.47□□□□□ -0.414e-7■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.884e-7■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 RIF1-207ENST00000454583 3552 ntTSL 24.91□□□□□ -1.625e-7■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 ZNF292-207ENST00000496806 770 ntTSL 314.16□□□□□ -0.142e-7■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.151e-6■■■□□ 15.5
HLTFQ14527 KIAA1551-207ENST00000541981 674 ntTSL 213.94□□□□□ -0.183e-6■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 KIAA1551-203ENST00000397578 814 ntTSL 38.09□□□□□ -1.113e-6■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 KIAA1551-204ENST00000535596 965 ntTSL 27.96□□□□□ -1.143e-6■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.23e-6■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 GOLGA8A-203ENST00000473125 6233 ntTSL 1 (best)12.49□□□□□ -0.418e-7■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 GOLGA8A-202ENST00000432566 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.538e-7■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 DLEU1-211ENST00000469127 320 ntTSL 57.71□□□□□ -1.182e-6■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 DLEU1-224ENST00000483444 332 ntTSL 1 (best)3.93□□□□□ -1.782e-6■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.232e-7■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.792e-7■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 DLC1-206ENST00000509922 455 ntTSL 410□□□□□ -0.812e-7■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 DLC1-204ENST00000503161 562 ntTSL 49.87□□□□□ -0.832e-7■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 ZNF649-207ENST00000600738 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.772e-7■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.882e-7■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 DIRC3-202ENST00000474063 3078 ntTSL 28.84□□□□□ -0.992e-7■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 PHYHIPL-204ENST00000486074 1971 ntTSL 29.89□□□□□ -0.834e-7■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.944e-7■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.284e-7■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.588e-7■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.528e-7■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.078e-7■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.088e-7■■■□□ 15.4
HLTFQ14527 DLEU1-214ENST00000470726 508 ntTSL 57.71□□□□□ -1.189e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.086e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 ERICH1-209ENST00000523415 3630 ntTSL 29.14□□□□□ -0.956e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.481e-6■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 NPSR1-AS1-207ENST00000539747 830 ntTSL 25.55□□□□□ -1.521e-6■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.269e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 SEC16A-206ENST00000431893 6465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.289e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 SEC16A-205ENST00000371706 8093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.439e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.459e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.183e-6■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 ZBTB1-203ENST00000554015 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.343e-6■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.753e-6■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.483e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 PRR5-210ENST00000459857 560 ntTSL 419.54■□□□□ 0.722e-6■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.463e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.443e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.263e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.213e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 AKAP12-202ENST00000354675 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.593e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 TPTE2P5-201ENST00000379515 450 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.63e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 TPTE2P5-204ENST00000633547 791 ntTSL 311.28□□□□□ -0.63e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 AKAP12-203ENST00000359755 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.73e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 AP000424.1-202ENST00000523831 331 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.873e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 DOCK5-203ENST00000444569 5335 ntTSL 59.49□□□□□ -0.893e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 DOCK5-205ENST00000467709 4844 ntTSL 58.32□□□□□ -1.083e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 UBQLN1-206ENST00000533705 6055 ntTSL 1 (best)7.27□□□□□ -1.243e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.226e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 MCF2L-218ENST00000442625 2710 ntTSL 1 (best)15.53■□□□□ 0.082e-6■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.072e-6■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 CHN2-203ENST00000409350 539 ntTSL 414.01□□□□□ -0.172e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 CHN2-213ENST00000439384 578 ntTSL 512.82□□□□□ -0.362e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 CHN2-205ENST00000409964 547 ntTSL 410.41□□□□□ -0.742e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 CHN2-220ENST00000474070 754 ntTSL 59.46□□□□□ -0.92e-7■■■□□ 15.3
HLTFQ14527 CHN2-226ENST00000495789 725 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.982e-7■■■□□ 15.3
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