Protein–RNA interactions for Protein: Q14181

POLA2, DNA polymerase alpha subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA2Q14181 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLA2Q14181 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLA2Q14181 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLA2Q14181 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLA2Q14181 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLA2Q14181 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLA2Q14181 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLA2Q14181 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLA2Q14181 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
POLA2Q14181 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLA2Q14181 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLA2Q14181 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLA2Q14181 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLA2Q14181 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLA2Q14181 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms