Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBFBQ13951 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBFBQ13951 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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