Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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