Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXE3Q13461 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms