Protein–RNA interactions for Protein: Q13277

STX3, Syntaxin-3, humanhuman

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX3Q13277 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX3Q13277 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX3Q13277 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX3Q13277 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX3Q13277 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX3Q13277 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX3Q13277 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX3Q13277 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX3Q13277 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX3Q13277 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
STX3Q13277 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
STX3Q13277 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
STX3Q13277 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STX3Q13277 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX3Q13277 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX3Q13277 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX3Q13277 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX3Q13277 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX3Q13277 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX3Q13277 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX3Q13277 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX3Q13277 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX3Q13277 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX3Q13277 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX3Q13277 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX3Q13277 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX3Q13277 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX3Q13277 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STX3Q13277 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX3Q13277 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STX3Q13277 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX3Q13277 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX3Q13277 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX3Q13277 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX3Q13277 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX3Q13277 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX3Q13277 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX3Q13277 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX3Q13277 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX3Q13277 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX3Q13277 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX3Q13277 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX3Q13277 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX3Q13277 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX3Q13277 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX3Q13277 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX3Q13277 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX3Q13277 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX3Q13277 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX3Q13277 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX3Q13277 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX3Q13277 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX3Q13277 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX3Q13277 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX3Q13277 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX3Q13277 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX3Q13277 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX3Q13277 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX3Q13277 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX3Q13277 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX3Q13277 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX3Q13277 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX3Q13277 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STX3Q13277 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STX3Q13277 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STX3Q13277 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX3Q13277 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX3Q13277 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX3Q13277 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX3Q13277 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX3Q13277 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX3Q13277 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX3Q13277 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STX3Q13277 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX3Q13277 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STX3Q13277 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX3Q13277 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX3Q13277 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX3Q13277 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX3Q13277 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STX3Q13277 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX3Q13277 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX3Q13277 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STX3Q13277 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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