Protein–RNA interactions for Protein: Q13239

SLA, Src-like-adapter, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAQ13239 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLAQ13239 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLAQ13239 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLAQ13239 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLAQ13239 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLAQ13239 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLAQ13239 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLAQ13239 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLAQ13239 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLAQ13239 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLAQ13239 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLAQ13239 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLAQ13239 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLAQ13239 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLAQ13239 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLAQ13239 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLAQ13239 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLAQ13239 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLAQ13239 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLAQ13239 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLAQ13239 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLAQ13239 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLAQ13239 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLAQ13239 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLAQ13239 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLAQ13239 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLAQ13239 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLAQ13239 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAQ13239 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAQ13239 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAQ13239 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAQ13239 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAQ13239 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAQ13239 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAQ13239 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAQ13239 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAQ13239 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAQ13239 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAQ13239 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAQ13239 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAQ13239 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAQ13239 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAQ13239 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAQ13239 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAQ13239 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAQ13239 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAQ13239 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAQ13239 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAQ13239 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAQ13239 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAQ13239 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAQ13239 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAQ13239 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAQ13239 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAQ13239 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAQ13239 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAQ13239 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAQ13239 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAQ13239 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAQ13239 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAQ13239 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAQ13239 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAQ13239 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAQ13239 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAQ13239 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAQ13239 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAQ13239 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAQ13239 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAQ13239 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAQ13239 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAQ13239 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAQ13239 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAQ13239 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAQ13239 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAQ13239 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAQ13239 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAQ13239 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAQ13239 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAQ13239 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAQ13239 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAQ13239 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAQ13239 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAQ13239 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAQ13239 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms