Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP4Q13115 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
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