Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRDNQ13061 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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