Protein–RNA interactions for Protein: Q12972

PPP1R8, Nuclear inhibitor of protein phosphatase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R8Q12972 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPP1R8Q12972 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP1R8Q12972 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPP1R8Q12972 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPP1R8Q12972 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPP1R8Q12972 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPP1R8Q12972 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1R8Q12972 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1R8Q12972 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1R8Q12972 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1R8Q12972 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1R8Q12972 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1R8Q12972 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1R8Q12972 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms