Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN13Q12923 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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