Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YKR104WYKR104W 921 nt5.07□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.07□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 YBR016WYBR016W 387 nt5.07□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 SMA1YPL027W 738 nt5.07□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 MET31YPL038W 534 nt5.07□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 NOC4YPR144C 1659 nt5.07□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 YHR182WYHR182W 2358 nt5.07□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 COT1YOR316C 1320 nt5.06□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 NOP16YER002W 696 nt5.06□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 UBC6YER100W 753 nt5.06□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 YER187WYER187W 426 nt5.06□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 YGR011WYGR011W 327 nt5.06□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 YMR245WYMR245W 621 nt5.06□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 snR10snR10 245 nt5.06□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 ZPS1YOL154W 750 nt5.06□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 MGR2YPL098C 342 nt5.06□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 KRS1YDR037W 1776 nt5.06□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 SED4YCR067C 3198 nt5.05□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 GLE2YER107C 1098 nt5.05□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 YFR035CYFR035C 345 nt5.05□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 SFK1YKL051W 1062 nt5.05□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 MIM2YLR099W-A 264 nt5.05□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 SFT2YBL102W 648 nt5.05□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 TRM10YOL093W 882 nt5.05□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 IXR1YKL032C 1794 nt5.05□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 GSH2YOL049W 1476 nt5.05□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 FPK1YNR047W 2682 nt5.05□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 ADE6YGR061C 4077 nt5.05□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 DOA1YKL213C 2148 nt5.05□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 SMP1YBR182C 1359 nt5.04□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 MET3YJR010W 1536 nt5.04□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 MCH4YOL119C 1506 nt5.04□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 YER084WYER084W 387 nt5.04□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 YIL028WYIL028W 399 nt5.04□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 ISY1YJR050W 708 nt5.04□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt5.04□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 YNL174WYNL174W 573 nt5.04□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 HRR25YPL204W 1485 nt5.04□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 STE20YHL007C 2820 nt5.03□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 RSC6YCR052W 1452 nt5.03□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 SLC1YDL052C 912 nt5.03□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 RRP1YDR087C 837 nt5.03□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 YER134CYER134C 537 nt5.03□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 TLG2YOL018C 1194 nt5.03□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 ROT2YBR229C 2865 nt5.03□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 SEC9YGR009C 1956 nt5.03□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 ATG32YIL146C 1590 nt5.03□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 MLF3YNL074C 1359 nt5.03□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 SPO74YGL170C 1242 nt5.02□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 TRX2YGR209C 315 nt5.02□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 SRN2YLR119W 642 nt5.02□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 DCI1YOR180C 816 nt5.02□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 YPL199CYPL199C 723 nt5.02□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 CBP1YJL209W 1965 nt5.02□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 YTA6YPL074W 2265 nt5.02□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 IBA57YJR122W 1494 nt5.01□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 DXO1YDR370C 1329 nt5.01□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 CLD1YGR110W 1338 nt5.01□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 AIM10YER087W 1731 nt5.01□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 IMG2YCR071C 441 nt5.01□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 PEX19YDL065C 1029 nt5.01□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 PAU17YLL025W 375 nt5.01□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 NHP6AYPR052C 282 nt5.01□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 UBA3YPR066W 900 nt5.01□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 YMR102CYMR102C 2505 nt5.01□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 PAL1YDR348C 1500 nt5.01□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 FUM1YPL262W 1467 nt5□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 AIR2YDL175C 1035 nt5□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 YDR417CYDR417C 372 nt5□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 CAX4YGR036C 720 nt5□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 APS1YLR170C 471 nt5□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 SOL1YNR034W 966 nt5□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 HMT1YBR034C 1047 nt5□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 REG2YBR050C 1017 nt5□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 FAP1YNL023C 2898 nt5□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 ASA1YPR085C 1332 nt4.99□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 PDR10YOR328W 4695 nt4.99□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 NUP116YMR047C 3342 nt4.99□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 RIM15YFL033C 5313 nt4.99□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 MGS1YNL218W 1764 nt4.99□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 MAD2YJL030W 591 nt4.99□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 ARG8YOL140W 1272 nt4.99□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 snR3snR3 194 nt4.99□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 RFT1YBL020W 1725 nt4.99□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 YDL027CYDL027C 1263 nt4.98□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 AAD4YDL243C 990 nt4.98□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 CAB1YDR531W 1104 nt4.98□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 ZRT1YGL255W 1131 nt4.98□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 MRPL39YML009C 213 nt4.98□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 HLJ1YMR161W 675 nt4.98□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 TRS33YOR115C 807 nt4.98□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 YPL191CYPL191C 1083 nt4.98□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 QCR2YPR191W 1107 nt4.98□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 BUD22YMR014W 1560 nt4.97□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 MHF2YDL160C-A 243 nt4.97□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 MMS21YEL019C 804 nt4.97□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 SIF2YBR103W 1608 nt4.97□□□□□ -1.61
VPS54Q12071 GMC1YDR506C 1827 nt4.96□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 LUC7YDL087C 786 nt4.96□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 RPL28YGL103W 450 nt4.96□□□□□ -1.62
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