Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 YNL134CYNL134C 1131 nt4.03□□□□□ -1.76
ATG41Q12048 FDC1YDR539W 1512 nt4.03□□□□□ -1.76
ATG41Q12048 FOB1YDR110W 1701 nt4.03□□□□□ -1.76
ATG41Q12048 HIR2YOR038C 2628 nt4.03□□□□□ -1.76
ATG41Q12048 TOG1YER184C 2385 nt4.03□□□□□ -1.76
ATG41Q12048 MOT2YER068W 1764 nt4.02□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 NSI1YDR026C 1713 nt4.02□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 YDR401WYDR401W 564 nt4.02□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 RMA1YKL132C 1293 nt4.02□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 GPI12YMR281W 915 nt4.02□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 CKB2YOR039W 777 nt4.02□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 WTM2YOR229W 1404 nt4.02□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 VPS72YDR485C 2388 nt4.02□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 RSC30YHR056C 2652 nt4.01□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 FUM1YPL262W 1467 nt4.01□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 RNA15YGL044C 891 nt4.01□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.01□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 FAF1YIL019W 1041 nt4.01□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 YJL218WYJL218W 591 nt4.01□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 LSO1YJR005C-A 282 nt4.01□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 HOS1YPR068C 1413 nt4.01□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 PRP28YDR243C 1767 nt4.01□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 YTA12YMR089C 2478 nt4.01□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 GSY1YFR015C 2127 nt4□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 DRS1YLL008W 2259 nt4□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 YDR056CYDR056C 618 nt4□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 DON1YDR273W 1098 nt4□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 COA3YJL062W-A 258 nt4□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 MRPL4YLR439W 960 nt4□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 SUA7YPR086W 1038 nt4□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 SFI1YLL003W 2841 nt3.99□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 MET7YOR241W 1647 nt3.99□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 CBF5YLR175W 1452 nt3.99□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 RPG1YBR079C 2895 nt3.99□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 MTC1YJL123C 1437 nt3.99□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 YAR030CYAR030C 342 nt3.99□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 CDC42YLR229C 576 nt3.99□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 CDC15YAR019C 2925 nt3.99□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 ESF1YDR365C 1887 nt3.98□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 NMD3YHR170W 1557 nt3.98□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 VAC7YNL054W 3498 nt3.98□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 BUD13YGL174W 801 nt3.98□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 ISA1YLL027W 753 nt3.98□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 SAP30YMR263W 606 nt3.98□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 SPO19YPL130W 672 nt3.98□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 REI1YBR267W 1182 nt3.98□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 PMC1YGL006W 3522 nt3.98□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 ADE13YLR359W 1449 nt3.97□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 DRN1YGR093W 1524 nt3.97□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 SEC9YGR009C 1956 nt3.97□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 ALG6YOR002W 1635 nt3.97□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 CPR4YCR069W 957 nt3.97□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 OST3YOR085W 1053 nt3.97□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 YPL191CYPL191C 1083 nt3.97□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 ATG14YBR128C 1035 nt3.97□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 TUB2YFL037W 1374 nt3.97□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 FAR10YLR238W 1437 nt3.96□□□□□ -1.77
ATG41Q12048 CTS2YDR371W 1536 nt3.96□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 YOL153CYOL153C 1746 nt3.96□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 ARN2YHL047C 1863 nt3.96□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 SKG6YHR149C 2205 nt3.95□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 MKC7YDR144C 1791 nt3.95□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 snR7-LsnR7-L 214 nt3.95□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 AVO2YMR068W 1281 nt3.95□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 YCL041CYCL041C 495 nt3.95□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 RIM21YNL294C 1602 nt3.95□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 RIA1YNL163C 3333 nt3.94□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 SWI3YJL176C 2478 nt3.94□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 YDL012CYDL012C 324 nt3.94□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 CAB1YDR531W 1104 nt3.94□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 NMA1YLR328W 1206 nt3.94□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 YML131WYML131W 1098 nt3.94□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 YPL025CYPL025C 558 nt3.94□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 GRE1YPL223C 507 nt3.94□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 SPC97YHR172W 2472 nt3.93□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 ARF2YDL137W 546 nt3.93□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 YGR266WYGR266W 2106 nt3.93□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt3.93□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 JJJ3YJR097W 519 nt3.93□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 CBP3YPL215W 1008 nt3.93□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 PEX32YBR168W 1242 nt3.93□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 UMP1YBR173C 447 nt3.93□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 SVF1YDR346C 1446 nt3.93□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 TRF5YNL299W 1929 nt3.93□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 NOP7YGR103W 1818 nt3.93□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 GAD1YMR250W 1758 nt3.92□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 SCS2YER120W 735 nt3.92□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 BNA6YFR047C 888 nt3.92□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 PEX22YAL055W 543 nt3.92□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 YNL217WYNL217W 981 nt3.92□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 AIF1YNR074C 1137 nt3.92□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 RAD52YML032C 1416 nt3.92□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 WTM1YOR230W 1314 nt3.92□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 TIF4632YGL049C 2745 nt3.92□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 LAS21YJL062W 2493 nt3.92□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 YMR221CYMR221C 1515 nt3.91□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 TYW3YGL050W 822 nt3.91□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 PDE1YGL248W 1110 nt3.91□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 YKL107WYKL107W 930 nt3.91□□□□□ -1.78
ATG41Q12048 TOM7YNL070W 183 nt3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.2 ms