Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt5.67□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 MRM2YGL136C 963 nt5.67□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt5.67□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 YNG1YOR064C 660 nt5.67□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 FOB1YDR110W 1701 nt5.67□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 UBC8YEL012W 657 nt5.66□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 SOL1YNR034W 966 nt5.66□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 ZPS1YOL154W 750 nt5.66□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 YDR132CYDR132C 1488 nt5.65□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 FHL1YPR104C 2811 nt5.65□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 FRT2YAL028W 1587 nt5.65□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 HST4YDR191W 1113 nt5.65□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 CIN5YOR028C 888 nt5.65□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 NSI1YDR026C 1713 nt5.65□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 DPH6YLR143W 2058 nt5.65□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 FRE7YOL152W 1863 nt5.64□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 CTR3YLR411W 726 nt5.64□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 SSH4YKL124W 1740 nt5.64□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 SED4YCR067C 3198 nt5.64□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 OXP1YKL215C 3861 nt5.64□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 STE7YDL159W 1548 nt5.64□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 ATR1YML116W 1629 nt5.63□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 MRPL25YGR076C 474 nt5.63□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 OSW5YMR148W 447 nt5.63□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 ADD37YMR184W 597 nt5.63□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 YGP1YNL160W 1065 nt5.63□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 YOL035CYOL035C 303 nt5.63□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.63□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.63□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 RRP3YHR065C 1506 nt5.63□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 TKL1YPR074C 2043 nt5.62□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 SPC97YHR172W 2472 nt5.62□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 YDL012CYDL012C 324 nt5.62□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 TRS23YDR246W 660 nt5.62□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 PCL6YER059W 1263 nt5.62□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 RFC2YJR068W 1062 nt5.62□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 UBI4YLL039C 1146 nt5.62□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 RPC19YNL113W 429 nt5.62□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 MRP51YPL118W 1035 nt5.62□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 NOP2YNL061W 1857 nt5.62□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 ASP1YDR321W 1146 nt5.61□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 YDR396WYDR396W 501 nt5.61□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 RPL28YGL103W 450 nt5.61□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 SLD2YKL108W 1362 nt5.61□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 MUM3YOR298W 1440 nt5.61□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 CPA1YOR303W 1236 nt5.61□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 MET31YPL038W 534 nt5.61□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 SYP1YCR030C 2613 nt5.61□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 LCB2YDR062W 1686 nt5.6□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 ASA1YPR085C 1332 nt5.6□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 KRE28YDR532C 1158 nt5.6□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 DBP8YHR169W 1296 nt5.6□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 RRN9YMR270C 1098 nt5.6□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 APC4YDR118W 1959 nt5.6□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 HAP1YLR256W 4509 nt5.6□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 CCZ1YBR131W 2115 nt5.59□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 CAF4YKR036C 1932 nt5.59□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 RXT3YDL076C 885 nt5.59□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 SPO12YHR152W 522 nt5.59□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 RAD30YDR419W 1899 nt5.59□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 EXO70YJL085W 1872 nt5.59□□□□□ -1.51
CTI6Q08923 LAP2YNL045W 2016 nt5.58□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 APM2YHL019C 1818 nt5.58□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 GUP2YPL189W 1830 nt5.58□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt5.58□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 SLZ1YNL196C 897 nt5.58□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 YOR1YGR281W 4434 nt5.58□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 CDC4YFL009W 2340 nt5.58□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 MAC1YMR021C 1254 nt5.57□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 MRE11YMR224C 2079 nt5.57□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 DAL81YIR023W 2913 nt5.57□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 PRT1YOR361C 2292 nt5.57□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 DNF2YDR093W 4839 nt5.57□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 AAD6YFL056C 639 nt5.56□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 ISY1YJR050W 708 nt5.56□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 snR17bsnR17b 332 nt5.56□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 HIR2YOR038C 2628 nt5.55□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 MMS21YEL019C 804 nt5.55□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 RPL12AYEL054C 498 nt5.55□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 YMR245WYMR245W 621 nt5.55□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 TLG2YOL018C 1194 nt5.55□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 QCR2YPR191W 1107 nt5.55□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 VID22YLR373C 2706 nt5.55□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 FOX2YKR009C 2703 nt5.54□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 APE1YKL103C 1545 nt5.54□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 SUB2YDL084W 1341 nt5.54□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 MID2YLR332W 1131 nt5.54□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.54□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 TOM40YMR203W 1164 nt5.54□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 TRS33YOR115C 807 nt5.54□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 HXT14YNL318C 1623 nt5.54□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 MGS1YNL218W 1764 nt5.54□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 AXL2YIL140W 2472 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 SIP5YMR140W 1470 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 FLC3YGL139W 2409 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 GLT1YDL171C 6438 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 TEL2YGR099W 2067 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 SUP56tL(CAA)A 82 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 SUP53tL(CAA)C 82 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.9 ms