Protein–RNA interactions for Protein: Q08641

ABP140, tRNA(Thr) (cytosine(32)-N(3))-methyltransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ABP140Q08641 NPT1YOR209C 1290 nt4.98□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.98□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.98□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 YTA12YMR089C 2478 nt4.98□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 SUM1YDR310C 3189 nt4.98□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 SYP1YCR030C 2613 nt4.97□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 LPL1YOR059C 1353 nt4.97□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 LYS5YGL154C 819 nt4.97□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt4.97□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 YJL220WYJL220W 453 nt4.97□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 CSR1YLR380W 1227 nt4.97□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.97□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 AIF1YNR074C 1137 nt4.97□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 YOR342CYOR342C 960 nt4.97□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 HSP82YPL240C 2130 nt4.97□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 VHC1YBR235W 3363 nt4.97□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 FAA3YIL009W 2085 nt4.96□□□□□ -1.61
ABP140Q08641 MDR1YGR100W 2853 nt4.96□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 KAR2YJL034W 2049 nt4.96□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 YPL245WYPL245W 1365 nt4.96□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 LHP1YDL051W 828 nt4.96□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 ORM1YGR038W 669 nt4.96□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 ATG14YBR128C 1035 nt4.96□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 SAP155YFR040W 3009 nt4.96□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 KRS1YDR037W 1776 nt4.96□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 SUP35YDR172W 2058 nt4.95□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 BOP2YLR267W 1713 nt4.95□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 APC4YDR118W 1959 nt4.95□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 YKL023WYKL023W 834 nt4.95□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 NMA1YLR328W 1206 nt4.95□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 SLZ1YNL196C 897 nt4.95□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 GDE1YPL110C 3672 nt4.95□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 STP4YDL048C 1473 nt4.94□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.94□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 SAP30YMR263W 606 nt4.94□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 MEC3YLR288C 1425 nt4.94□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.94□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 RVB1YDR190C 1392 nt4.93□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 PAD1YDR538W 729 nt4.93□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 COG1YGL223C 1254 nt4.93□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 GPP1YIL053W 753 nt4.93□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 RPP0YLR340W 939 nt4.93□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 BLM10YFL007W 6432 nt4.93□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 VBA2YBR293W 1425 nt4.92□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 YMR196WYMR196W 3267 nt4.92□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 FRS1YLR060W 1788 nt4.92□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 SUT1YGL162W 900 nt4.92□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 RCL1YOL010W 1104 nt4.92□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 GSP2YOR185C 663 nt4.92□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 GIP2YER054C 1647 nt4.92□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 HIR2YOR038C 2628 nt4.92□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 PRP28YDR243C 1767 nt4.91□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 ARF2YDL137W 546 nt4.91□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 SRG1SRG1 551 nt4.91□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 IPK1YDR315C 846 nt4.91□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 CCS1YMR038C 750 nt4.91□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 UMP1YBR173C 447 nt4.91□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 GRC3YLL035W 1899 nt4.91□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 MCM4YPR019W 2802 nt4.91□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 PEP5YMR231W 3090 nt4.91□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 FRE1YLR214W 2061 nt4.9□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 ESF1YDR365C 1887 nt4.9□□□□□ -1.62
ABP140Q08641 TYW3YGL050W 822 nt4.9□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 YGR016WYGR016W 573 nt4.9□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 SSB2YNL209W 1842 nt4.9□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 RTC5YOR118W 1704 nt4.89□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 MAG2YLR427W 2013 nt4.89□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt4.89□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 OAZ1YPL052W 879 nt4.89□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 YPR109WYPR109W 885 nt4.89□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 SAF1YBR280C 1914 nt4.89□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 SDA1YGR245C 2304 nt4.89□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 YGR266WYGR266W 2106 nt4.88□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 DCD1YHR144C 939 nt4.88□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 YJL215CYJL215C 360 nt4.88□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 PUS5YLR165C 765 nt4.88□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 YIM1YMR152W 1098 nt4.88□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 YNL134CYNL134C 1131 nt4.88□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 MAK3YPR051W 531 nt4.88□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 YLH47YPR125W 1365 nt4.88□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 TDA6YPR157W 1404 nt4.88□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 FDC1YDR539W 1512 nt4.87□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 ABF1YKL112W 2196 nt4.87□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 YEH2YLR020C 1617 nt4.86□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 MSE1YOL033W 1611 nt4.86□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 TRM44YPL030W 1704 nt4.86□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 STR2YJR130C 1920 nt4.86□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.86□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 RRB1YMR131C 1536 nt4.86□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 RIM21YNL294C 1602 nt4.86□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 KGD1YIL125W 3045 nt4.86□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 RCK2YLR248W 1833 nt4.86□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 FAA4YMR246W 2085 nt4.85□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 LEU1YGL009C 2340 nt4.85□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 CDC48YDL126C 2508 nt4.85□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 TSL1YML100W 3297 nt4.85□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 YDL012CYDL012C 324 nt4.85□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 SUR2YDR297W 1050 nt4.85□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 YGR066CYGR066C 879 nt4.85□□□□□ -1.63
ABP140Q08641 CIA2YHR122W 696 nt4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.3 ms