Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNK2Q07912 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms