Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms