Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FMODQ06828 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FMODQ06828 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FMODQ06828 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FMODQ06828 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FMODQ06828 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FMODQ06828 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FMODQ06828 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FMODQ06828 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FMODQ06828 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FMODQ06828 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FMODQ06828 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FMODQ06828 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FMODQ06828 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FMODQ06828 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FMODQ06828 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FMODQ06828 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FMODQ06828 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FMODQ06828 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FMODQ06828 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FMODQ06828 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FMODQ06828 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FMODQ06828 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FMODQ06828 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FMODQ06828 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FMODQ06828 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FMODQ06828 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FMODQ06828 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FMODQ06828 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FMODQ06828 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FMODQ06828 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FMODQ06828 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FMODQ06828 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FMODQ06828 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FMODQ06828 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FMODQ06828 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FMODQ06828 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FMODQ06828 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FMODQ06828 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FMODQ06828 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FMODQ06828 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FMODQ06828 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FMODQ06828 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FMODQ06828 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FMODQ06828 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FMODQ06828 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FMODQ06828 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FMODQ06828 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FMODQ06828 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FMODQ06828 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FMODQ06828 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FMODQ06828 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FMODQ06828 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FMODQ06828 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FMODQ06828 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FMODQ06828 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FMODQ06828 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FMODQ06828 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FMODQ06828 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FMODQ06828 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FMODQ06828 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FMODQ06828 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FMODQ06828 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FMODQ06828 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FMODQ06828 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FMODQ06828 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FMODQ06828 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FMODQ06828 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FMODQ06828 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FMODQ06828 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FMODQ06828 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FMODQ06828 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FMODQ06828 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FMODQ06828 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FMODQ06828 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FMODQ06828 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FMODQ06828 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FMODQ06828 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FMODQ06828 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FMODQ06828 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FMODQ06828 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FMODQ06828 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FMODQ06828 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FMODQ06828 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FMODQ06828 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FMODQ06828 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FMODQ06828 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FMODQ06828 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FMODQ06828 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FMODQ06828 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FMODQ06828 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FMODQ06828 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FMODQ06828 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FMODQ06828 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FMODQ06828 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FMODQ06828 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FMODQ06828 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FMODQ06828 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FMODQ06828 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FMODQ06828 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms