Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CALD1Q05682 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CALD1Q05682 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms