Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCQQ04759 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms