Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	YBR138C	YBR138C	1575 nt		5.62	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	HXT5	YHR096C	1779 nt		5.62	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	YCR006C	YCR006C	474 nt		5.61	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	SDA1	YGR245C	2304 nt		5.61	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	CIA2	YHR122W	696 nt		5.61	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	YPR071W	YPR071W	636 nt		5.61	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	YNL095C	YNL095C	1929 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	RFA1	YAR007C	1866 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	BRE2	YLR015W	1518 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	PCL6	YER059W	1263 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	FMP48	YGR052W	1110 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	SAP30	YMR263W	606 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	PRE2	YPR103W	864 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	MNN2	YBR015C	1794 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	YMR102C	YMR102C	2505 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	MEC3	YLR288C	1425 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	CUE2	YKL090W	1332 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	TRS23	YDR246W	660 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	TYW3	YGL050W	822 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	DBP8	YHR169W	1296 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	NMD4	YLR363C	657 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	YGP1	YNL160W	1065 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	CIN5	YOR028C	888 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	UMP1	YBR173C	447 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	UBP7	YIL156W	3216 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	GMC1	YDR506C	1827 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	SSH4	YKL124W	1740 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	YGL088W	YGL088W	366 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	TRX2	YGR209C	315 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	YNL181W	YNL181W	1224 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	YPR150W	YPR150W	522 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	SUE1	YPR151C	621 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	SIS2	YKR072C	1689 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	GIP2	YER054C	1647 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	NOP58	YOR310C	1536 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	DPH6	YLR143W	2058 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	RTC1	YOL138C	4026 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	VCX1	YDL128W	1236 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	ARP10	YDR106W	855 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	TYS1	YGR185C	1185 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	ECM1	YAL059W	639 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	SPS18	YNL204C	903 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	PCL1	YNL289W	840 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	COA2	YPL189C-A	207 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	YPL278C	YPL278C	303 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	YOR1	YGR281W	4434 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	HXT14	YNL318C	1623 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	ELP2	YGR200C	2367 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	ARF2	YDL137W	546 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	AAD6	YFL056C	639 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	YFR052C-A	YFR052C-A	306 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	CTR3	YLR411W	726 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	YMR245W	YMR245W	621 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	TLG2	YOL018C	1194 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	snR32	snR32	188 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	YTA12	YMR089C	2478 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	EXO1	YOR033C	2109 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	GDB1	YPR184W	4611 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	STB3	YDR169C	1542 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	RPL43B	YJR094W-A	279 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	AST1	YBL069W	1290 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	YOL079W	YOL079W	399 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	MET31	YPL038W	534 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	YPL113C	YPL113C	1191 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	SPN1	YPR133C	1233 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	RAD30	YDR419W	1899 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	BUD22	YMR014W	1560 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	AZR1	YGR224W	1842 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	UBI4	YLL039C	1146 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	SYG1	YIL047C	2709 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	FRT2	YAL028W	1587 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	PWP1	YLR196W	1731 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	RAD53	YPL153C	2466 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	YKR104W	YKR104W	921 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	YMR086C-A	YMR086C-A	339 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	RRN9	YMR270C	1098 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	SOL1	YNR034W	966 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	APC4	YDR118W	1959 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	CBP1	YJL209W	1965 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SYF1	Q04048	CYK3	YDL117W	2658 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	ASF2	YDL197C	1578 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	APM1	YPL259C	1428 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	SNM1	YDR478W	597 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	RML2	YEL050C	1182 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	UBC6	YER100W	753 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	tL(UAG)J	tL(UAG)J	82 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	tL(UAG)L1	tL(UAG)L1	82 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	tL(UAG)L2	tL(UAG)L2	82 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	RFC2	YJR068W	1062 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	YBL006W-A	YBL006W-A	150 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	SLZ1	YNL196C	897 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	LYS2	YBR115C	4179 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	MET3	YJR010W	1536 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	RAD57	YDR004W	1383 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	FOX2	YKR009C	2703 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	GSH2	YOL049W	1476 nt		5.51	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	GLT1	YDL171C	6438 nt		5.51	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	YEL077C	YEL077C	3834 nt		5.51	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	YNG1	YOR064C	660 nt		5.51	□□□□□ -1.53

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.2 ms