Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAP1Q01518 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms