Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms