Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDPQ00604 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDPQ00604 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDPQ00604 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDPQ00604 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDPQ00604 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDPQ00604 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDPQ00604 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDPQ00604 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDPQ00604 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDPQ00604 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDPQ00604 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDPQ00604 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDPQ00604 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDPQ00604 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDPQ00604 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDPQ00604 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDPQ00604 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDPQ00604 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NDPQ00604 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDPQ00604 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDPQ00604 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDPQ00604 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDPQ00604 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDPQ00604 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDPQ00604 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDPQ00604 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDPQ00604 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDPQ00604 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDPQ00604 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDPQ00604 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDPQ00604 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDPQ00604 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDPQ00604 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDPQ00604 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDPQ00604 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NDPQ00604 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDPQ00604 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDPQ00604 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDPQ00604 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDPQ00604 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDPQ00604 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDPQ00604 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDPQ00604 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDPQ00604 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDPQ00604 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDPQ00604 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDPQ00604 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDPQ00604 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDPQ00604 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDPQ00604 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDPQ00604 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDPQ00604 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDPQ00604 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDPQ00604 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDPQ00604 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDPQ00604 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDPQ00604 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDPQ00604 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDPQ00604 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDPQ00604 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDPQ00604 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDPQ00604 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NDPQ00604 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDPQ00604 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDPQ00604 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDPQ00604 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDPQ00604 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDPQ00604 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDPQ00604 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDPQ00604 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms