Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms