Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms