Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTC1P68032 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms