Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms