Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms