Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVK-21P61565 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms