Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STX1BP61266 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX1BP61266 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX1BP61266 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX1BP61266 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX1BP61266 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX1BP61266 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX1BP61266 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX1BP61266 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX1BP61266 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX1BP61266 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX1BP61266 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX1BP61266 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX1BP61266 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX1BP61266 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX1BP61266 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX1BP61266 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX1BP61266 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX1BP61266 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX1BP61266 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX1BP61266 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX1BP61266 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX1BP61266 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX1BP61266 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX1BP61266 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX1BP61266 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX1BP61266 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX1BP61266 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STX1BP61266 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX1BP61266 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX1BP61266 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX1BP61266 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX1BP61266 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX1BP61266 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX1BP61266 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX1BP61266 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX1BP61266 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX1BP61266 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX1BP61266 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STX1BP61266 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
STX1BP61266 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
STX1BP61266 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX1BP61266 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX1BP61266 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX1BP61266 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STX1BP61266 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STX1BP61266 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX1BP61266 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX1BP61266 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX1BP61266 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX1BP61266 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STX1BP61266 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX1BP61266 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX1BP61266 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX1BP61266 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX1BP61266 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX1BP61266 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX1BP61266 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STX1BP61266 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX1BP61266 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX1BP61266 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX1BP61266 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STX1BP61266 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX1BP61266 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX1BP61266 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX1BP61266 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX1BP61266 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX1BP61266 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STX1BP61266 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STX1BP61266 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX1BP61266 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STX1BP61266 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX1BP61266 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX1BP61266 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX1BP61266 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX1BP61266 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX1BP61266 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX1BP61266 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX1BP61266 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX1BP61266 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX1BP61266 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX1BP61266 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX1BP61266 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX1BP61266 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STX1BP61266 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX1BP61266 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX1BP61266 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX1BP61266 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX1BP61266 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX1BP61266 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX1BP61266 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX1BP61266 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX1BP61266 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX1BP61266 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX1BP61266 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX1BP61266 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX1BP61266 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX1BP61266 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX1BP61266 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX1BP61266 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms