Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARF3P61204 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARF3P61204 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARF3P61204 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARF3P61204 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARF3P61204 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARF3P61204 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARF3P61204 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARF3P61204 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARF3P61204 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARF3P61204 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARF3P61204 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARF3P61204 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARF3P61204 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARF3P61204 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARF3P61204 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARF3P61204 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARF3P61204 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARF3P61204 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARF3P61204 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARF3P61204 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARF3P61204 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARF3P61204 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ARF3P61204 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARF3P61204 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARF3P61204 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARF3P61204 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARF3P61204 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF3P61204 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF3P61204 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF3P61204 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF3P61204 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF3P61204 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF3P61204 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF3P61204 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF3P61204 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF3P61204 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF3P61204 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF3P61204 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF3P61204 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF3P61204 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF3P61204 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF3P61204 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF3P61204 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF3P61204 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF3P61204 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF3P61204 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF3P61204 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF3P61204 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF3P61204 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF3P61204 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF3P61204 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF3P61204 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF3P61204 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF3P61204 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF3P61204 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF3P61204 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF3P61204 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF3P61204 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF3P61204 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF3P61204 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF3P61204 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF3P61204 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF3P61204 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF3P61204 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF3P61204 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF3P61204 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF3P61204 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF3P61204 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF3P61204 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF3P61204 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF3P61204 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF3P61204 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF3P61204 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARF3P61204 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF3P61204 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF3P61204 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF3P61204 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF3P61204 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF3P61204 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF3P61204 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF3P61204 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF3P61204 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF3P61204 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF3P61204 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF3P61204 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF3P61204 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF3P61204 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARF3P61204 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARF3P61204 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARF3P61204 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARF3P61204 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARF3P61204 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARF3P61204 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARF3P61204 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARF3P61204 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARF3P61204 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARF3P61204 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARF3P61204 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARF3P61204 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 369 ms