Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTBP60709 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTBP60709 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTBP60709 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTBP60709 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTBP60709 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTBP60709 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTBP60709 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTBP60709 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTBP60709 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTBP60709 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTBP60709 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTBP60709 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTBP60709 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTBP60709 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTBP60709 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTBP60709 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTBP60709 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTBP60709 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTBP60709 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTBP60709 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTBP60709 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTBP60709 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTBP60709 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTBP60709 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTBP60709 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTBP60709 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTBP60709 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTBP60709 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTBP60709 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTBP60709 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTBP60709 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTBP60709 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTBP60709 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTBP60709 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTBP60709 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTBP60709 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTBP60709 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTBP60709 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTBP60709 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTBP60709 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTBP60709 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTBP60709 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTBP60709 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTBP60709 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTBP60709 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTBP60709 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTBP60709 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTBP60709 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTBP60709 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTBP60709 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTBP60709 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTBP60709 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTBP60709 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTBP60709 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTBP60709 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTBP60709 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTBP60709 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTBP60709 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTBP60709 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTBP60709 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTBP60709 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTBP60709 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTBP60709 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTBP60709 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTBP60709 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTBP60709 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTBP60709 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTBP60709 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTBP60709 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTBP60709 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTBP60709 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTBP60709 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTBP60709 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTBP60709 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTBP60709 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTBP60709 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTBP60709 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTBP60709 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTBP60709 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTBP60709 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTBP60709 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTBP60709 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTBP60709 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTBP60709 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTBP60709 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTBP60709 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTBP60709 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACTBP60709 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACTBP60709 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACTBP60709 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACTBP60709 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACTBP60709 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ACTBP60709 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACTBP60709 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACTBP60709 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACTBP60709 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACTBP60709 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACTBP60709 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACTBP60709 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms