Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCDC1P59894 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms