Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4BP1P59074 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms