Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP1LP55160 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCKAP1LP55160 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms