Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H2P55055 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms