Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GYS2P54840 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GYS2P54840 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GYS2P54840 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GYS2P54840 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GYS2P54840 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GYS2P54840 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GYS2P54840 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GYS2P54840 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GYS2P54840 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GYS2P54840 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GYS2P54840 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GYS2P54840 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GYS2P54840 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GYS2P54840 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GYS2P54840 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GYS2P54840 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GYS2P54840 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GYS2P54840 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GYS2P54840 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GYS2P54840 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GYS2P54840 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GYS2P54840 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GYS2P54840 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GYS2P54840 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GYS2P54840 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GYS2P54840 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GYS2P54840 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GYS2P54840 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GYS2P54840 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GYS2P54840 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GYS2P54840 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GYS2P54840 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GYS2P54840 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GYS2P54840 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GYS2P54840 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GYS2P54840 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GYS2P54840 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GYS2P54840 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GYS2P54840 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GYS2P54840 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GYS2P54840 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GYS2P54840 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GYS2P54840 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GYS2P54840 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GYS2P54840 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GYS2P54840 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GYS2P54840 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GYS2P54840 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GYS2P54840 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GYS2P54840 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GYS2P54840 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GYS2P54840 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GYS2P54840 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GYS2P54840 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GYS2P54840 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GYS2P54840 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GYS2P54840 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GYS2P54840 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GYS2P54840 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GYS2P54840 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GYS2P54840 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GYS2P54840 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GYS2P54840 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GYS2P54840 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GYS2P54840 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GYS2P54840 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GYS2P54840 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GYS2P54840 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GYS2P54840 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GYS2P54840 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GYS2P54840 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GYS2P54840 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GYS2P54840 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GYS2P54840 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GYS2P54840 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GYS2P54840 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GYS2P54840 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GYS2P54840 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GYS2P54840 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GYS2P54840 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GYS2P54840 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GYS2P54840 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GYS2P54840 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GYS2P54840 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GYS2P54840 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GYS2P54840 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GYS2P54840 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GYS2P54840 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GYS2P54840 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GYS2P54840 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GYS2P54840 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GYS2P54840 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GYS2P54840 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GYS2P54840 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GYS2P54840 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GYS2P54840 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GYS2P54840 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GYS2P54840 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GYS2P54840 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms