Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA4P54764 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA4P54764 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms