Protein–RNA interactions for Protein: P53947

YNL058C, Vacuolar membrane protein YNL058C, yeastyeast

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL058CP53947 COX11YPL132W 903 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 UBS1YBR165W 834 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 AME1YBR211C 975 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 TRE1YPL176C 2352 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 SFI1YLL003W 2841 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 RKM2YDR198C 1440 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 HRK1YOR267C 2280 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 YHR177WYHR177W 1362 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 MRP13YGR084C 1020 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 SPO16YHR153C 597 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 EGD2YHR193C 525 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 MHO1YJR008W 1017 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 UBC12YLR306W 567 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 MFA2YNL145W 117 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 PFA4YOL003C 1137 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 DSC2YOL073C 969 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 PEX34YCL056C 435 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 YCR099CYCR099C 468 nt5.28□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 YGL101WYGL101W 648 nt5.28□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 YIL028WYIL028W 399 nt5.28□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 PGU1YJR153W 1086 nt5.28□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 CBC2YPL178W 627 nt5.28□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 OPY2YPR075C 1083 nt5.28□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 SBE2YDR351W 2595 nt5.28□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 ERD1YDR414C 1089 nt5.27□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 TOM40YMR203W 1164 nt5.27□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 DAL82YNL314W 768 nt5.27□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt5.27□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 IRC14YOR135C 342 nt5.27□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 ISU2YOR226C 471 nt5.27□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 RSC30YHR056C 2652 nt5.27□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 SAC1YKL212W 1872 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 PHO90YJL198W 2646 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 ERG26YGL001C 1050 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 YHL045WYHL045W 348 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 YIL086CYIL086C 309 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 YKL169CYKL169C 384 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 YKR104WYKR104W 921 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 DCN1YLR128W 810 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 RTT106YNL206C 1368 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 PCA1YBR295W 3651 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 MMT2YPL224C 1455 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 MRE11YMR224C 2079 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 GRS1YBR121C 2004 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 KIN28YDL108W 921 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 YDL157CYDL157C 357 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 HST4YDR191W 1113 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 COQ4YDR204W 1008 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 PRP45YAL032C 1140 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 MRPL4YLR439W 960 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 DIA1YMR316W 1011 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 RPA49YNL248C 1248 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 YOR024WYOR024W 324 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 VPS28YPL065W 729 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 SED4YCR067C 3198 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 VPS36YLR417W 1701 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 HFA1YMR207C 6372 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 MEF2YJL102W 2460 nt5.24□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 MOT2YER068W 1764 nt5.24□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 DAK1YML070W 1755 nt5.24□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 CDC19YAL038W 1503 nt5.24□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 SKM1YOL113W 1968 nt5.24□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 MAC1YMR021C 1254 nt5.24□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 YOR289WYOR289W 756 nt5.24□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 DCC1YCL016C 1143 nt5.24□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 TOS4YLR183C 1470 nt5.24□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 IML2YJL082W 2196 nt5.23□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 RAD16YBR114W 2373 nt5.23□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 TDA11YHR159W 1515 nt5.23□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 GRX6YDL010W 696 nt5.23□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 YDR161WYDR161W 1164 nt5.23□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 HSP31YDR533C 714 nt5.23□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 FMP33YJL161W 543 nt5.23□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 CBF1YJR060W 1056 nt5.23□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 BAG7YOR134W 1230 nt5.23□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 STE50YCL032W 1041 nt5.23□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 CTS1YLR286C 1689 nt5.22□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 YGR011WYGR011W 327 nt5.22□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 YGR269WYGR269W 327 nt5.22□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 SSP120YLR250W 705 nt5.22□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 GTR1YML121W 933 nt5.22□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 UBA3YPR066W 900 nt5.22□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 YSA1YBR111C 696 nt5.22□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 BIT2YBR270C 1638 nt5.22□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 HIS4YCL030C 2400 nt5.22□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 YGR266WYGR266W 2106 nt5.21□□□□□ -1.57
YNL058CP53947 BBC1YJL020C 3474 nt5.21□□□□□ -1.58
YNL058CP53947 UTR4YEL038W 684 nt5.21□□□□□ -1.58
YNL058CP53947 IRC7YFR055W 1023 nt5.21□□□□□ -1.58
YNL058CP53947 YLR125WYLR125W 411 nt5.21□□□□□ -1.58
YNL058CP53947 BLS1YLR408C 369 nt5.21□□□□□ -1.58
YNL058CP53947 HLJ1YMR161W 675 nt5.21□□□□□ -1.58
YNL058CP53947 TPS3YMR261C 3165 nt5.2□□□□□ -1.58
YNL058CP53947 PHO8YDR481C 1701 nt5.2□□□□□ -1.58
YNL058CP53947 UBP9YER098W 2265 nt5.2□□□□□ -1.58
YNL058CP53947 TRM8YDL201W 861 nt5.2□□□□□ -1.58
YNL058CP53947 PRO3YER023W 861 nt5.2□□□□□ -1.58
YNL058CP53947 YER138W-AYER138W-A 105 nt5.2□□□□□ -1.58
YNL058CP53947 YER187WYER187W 426 nt5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 133.1 ms