Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	MNN1	YER001W	2289 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	PIC2	YER053C	903 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	GLE2	YER107C	1098 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	NAG1	YGR031C-A	492 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	FMP48	YGR052W	1110 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	ECM1	YAL059W	639 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	GAL10	YBR019C	2100 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	RSC6	YCR052W	1452 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	PCL10	YGL134W	1302 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	CLD1	YGR110W	1338 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	EMP46	YLR080W	1335 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	BRE2	YLR015W	1518 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	PRR1	YKL116C	1557 nt		4.91	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	LAP2	YNL045W	2016 nt		4.91	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	YEL045C	YEL045C	426 nt		4.91	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	MNN11	YJL183W	1269 nt		4.91	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	PGU1	YJR153W	1086 nt		4.91	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	YML119W	YML119W	1074 nt		4.91	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	ETT1	YOR051C	1239 nt		4.91	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	MRI1	YPR118W	1236 nt		4.91	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	KTR3	YBR205W	1215 nt		4.91	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	SSA2	YLL024C	1920 nt		4.91	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	KAP114	YGL241W	3015 nt		4.91	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	RIM21	YNL294C	1602 nt		4.9	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	RKM2	YDR198C	1440 nt		4.9	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	COQ6	YGR255C	1440 nt		4.9	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	IWR1	YDL115C	1062 nt		4.9	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	SKI8	YGL213C	1194 nt		4.9	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	MID2	YLR332W	1131 nt		4.9	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	SCW10	YMR305C	1170 nt		4.9	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	NCE103	YNL036W	666 nt		4.9	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	UIP4	YPL186C	915 nt		4.9	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	SSB1	YDL229W	1842 nt		4.9	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	SSB2	YNL209W	1842 nt		4.9	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	CDC15	YAR019C	2925 nt		4.9	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	YPL260W	YPL260W	1656 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	MRE11	YMR224C	2079 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	YDL119C	YDL119C	924 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	SNM1	YDR478W	597 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	YER133W-A	YER133W-A	342 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	LYS5	YGL154C	819 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	SPO74	YGL170C	1242 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	MRP17	YKL003C	396 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	MIM2	YLR099W-A	264 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	MRPL4	YLR439W	960 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	GSM1	YJL103C	1857 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	CLA4	YNL298W	2529 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	MNT2	YGL257C	1677 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	ROT2	YBR229C	2865 nt		4.88	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	FPK1	YNR047W	2682 nt		4.88	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	KIN28	YDL108W	921 nt		4.88	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	KTI12	YKL110C	942 nt		4.88	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	AIM41	YOR215C	558 nt		4.88	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	ETR1	YBR026C	1143 nt		4.88	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	YPL102C	YPL102C	303 nt		4.88	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	SVF1	YDR346C	1446 nt		4.88	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	FUI1	YBL042C	1920 nt		4.87	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	PHO8	YDR481C	1701 nt		4.87	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	GCV1	YDR019C	1203 nt		4.87	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	CBF1	YJR060W	1056 nt		4.87	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	DCN1	YLR128W	810 nt		4.87	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	TAF4	YMR005W	1167 nt		4.87	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	TOM40	YMR203W	1164 nt		4.87	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	AVT1	YJR001W	1809 nt		4.87	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	PDR15	YDR406W	4590 nt		4.87	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	PFK1	YGR240C	2964 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	TRE1	YPL176C	2352 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	UBC6	YER100W	753 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	IRC7	YFR055W	1023 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	YGL118C	YGL118C	438 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	NIT2	YJL126W	924 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	YBL029W	YBL029W	1131 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	YBL081W	YBL081W	1107 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	PDX3	YBR035C	687 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	MET31	YPL038W	534 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	THP1	YOL072W	1368 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	VBA2	YBR293W	1425 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	MDM30	YLR368W	1797 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	MKS1	YNL076W	1755 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	GRC3	YLL035W	1899 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	PRT1	YOR361C	2292 nt		4.85	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	SLC1	YDL052C	912 nt		4.85	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	IPI1	YHR085W	1005 nt		4.85	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	YET2	YMR040W	483 nt		4.85	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	YOR292C	YOR292C	930 nt		4.85	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	ADE4	YMR300C	1533 nt		4.85	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	SIS2	YKR072C	1689 nt		4.85	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	IZH3	YLR023C	1632 nt		4.84	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	ATR1	YML116W	1629 nt		4.84	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	MAD3	YJL013C	1548 nt		4.84	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	TRS23	YDR246W	660 nt		4.84	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	YEL067C	YEL067C	588 nt		4.84	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	RAI1	YGL246C	1164 nt		4.84	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	TDH3	YGR192C	999 nt		4.84	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	TRX2	YGR209C	315 nt		4.84	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	YMR245W	YMR245W	621 nt		4.84	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	YNR068C	YNR068C	819 nt		4.84	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	RER2	YBR002C	861 nt		4.84	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	CBP3	YPL215W	1008 nt		4.84	□□□□□ -1.63
DSL1	P53847	PMT5	YDL093W	2232 nt		4.84	□□□□□ -1.64

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