Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPB1P53618 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPB1P53618 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COPB1P53618 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COPB1P53618 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COPB1P53618 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB1P53618 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB1P53618 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB1P53618 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB1P53618 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB1P53618 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB1P53618 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB1P53618 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB1P53618 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB1P53618 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB1P53618 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB1P53618 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB1P53618 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB1P53618 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB1P53618 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB1P53618 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB1P53618 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB1P53618 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB1P53618 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB1P53618 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB1P53618 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB1P53618 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB1P53618 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB1P53618 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB1P53618 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB1P53618 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB1P53618 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB1P53618 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB1P53618 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB1P53618 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB1P53618 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB1P53618 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB1P53618 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB1P53618 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB1P53618 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPB1P53618 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPB1P53618 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPB1P53618 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPB1P53618 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COPB1P53618 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPB1P53618 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPB1P53618 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPB1P53618 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPB1P53618 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPB1P53618 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB1P53618 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB1P53618 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB1P53618 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB1P53618 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB1P53618 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB1P53618 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB1P53618 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB1P53618 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB1P53618 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB1P53618 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB1P53618 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB1P53618 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB1P53618 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPB1P53618 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPB1P53618 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
COPB1P53618 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPB1P53618 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPB1P53618 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPB1P53618 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPB1P53618 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPB1P53618 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPB1P53618 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB1P53618 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB1P53618 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB1P53618 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB1P53618 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB1P53618 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB1P53618 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB1P53618 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB1P53618 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB1P53618 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB1P53618 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB1P53618 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB1P53618 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB1P53618 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB1P53618 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB1P53618 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB1P53618 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB1P53618 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB1P53618 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB1P53618 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB1P53618 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB1P53618 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB1P53618 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB1P53618 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB1P53618 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPB1P53618 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPB1P53618 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPB1P53618 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPB1P53618 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms