Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MVDP53602 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MVDP53602 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MVDP53602 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MVDP53602 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MVDP53602 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MVDP53602 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MVDP53602 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MVDP53602 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MVDP53602 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MVDP53602 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MVDP53602 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MVDP53602 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MVDP53602 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MVDP53602 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MVDP53602 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MVDP53602 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MVDP53602 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MVDP53602 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MVDP53602 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MVDP53602 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MVDP53602 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MVDP53602 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MVDP53602 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MVDP53602 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MVDP53602 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MVDP53602 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
MVDP53602 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MVDP53602 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MVDP53602 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MVDP53602 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MVDP53602 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MVDP53602 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MVDP53602 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MVDP53602 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MVDP53602 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MVDP53602 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MVDP53602 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MVDP53602 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MVDP53602 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MVDP53602 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MVDP53602 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MVDP53602 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MVDP53602 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MVDP53602 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MVDP53602 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MVDP53602 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MVDP53602 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MVDP53602 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MVDP53602 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MVDP53602 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MVDP53602 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MVDP53602 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MVDP53602 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MVDP53602 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MVDP53602 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MVDP53602 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MVDP53602 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MVDP53602 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MVDP53602 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MVDP53602 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MVDP53602 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MVDP53602 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MVDP53602 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MVDP53602 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MVDP53602 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MVDP53602 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MVDP53602 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MVDP53602 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MVDP53602 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MVDP53602 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MVDP53602 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MVDP53602 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MVDP53602 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MVDP53602 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MVDP53602 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MVDP53602 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MVDP53602 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MVDP53602 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MVDP53602 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MVDP53602 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MVDP53602 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MVDP53602 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MVDP53602 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MVDP53602 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MVDP53602 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MVDP53602 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MVDP53602 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MVDP53602 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MVDP53602 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MVDP53602 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MVDP53602 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MVDP53602 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MVDP53602 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MVDP53602 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MVDP53602 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MVDP53602 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MVDP53602 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MVDP53602 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MVDP53602 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms