Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOSBP53539 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOSBP53539 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOSBP53539 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOSBP53539 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOSBP53539 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOSBP53539 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOSBP53539 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FOSBP53539 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOSBP53539 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOSBP53539 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOSBP53539 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOSBP53539 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOSBP53539 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOSBP53539 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOSBP53539 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOSBP53539 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOSBP53539 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOSBP53539 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOSBP53539 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOSBP53539 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOSBP53539 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOSBP53539 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOSBP53539 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOSBP53539 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOSBP53539 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOSBP53539 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOSBP53539 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOSBP53539 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOSBP53539 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOSBP53539 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOSBP53539 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOSBP53539 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOSBP53539 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOSBP53539 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOSBP53539 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOSBP53539 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOSBP53539 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOSBP53539 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOSBP53539 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOSBP53539 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOSBP53539 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOSBP53539 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOSBP53539 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOSBP53539 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FOSBP53539 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOSBP53539 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOSBP53539 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOSBP53539 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOSBP53539 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOSBP53539 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOSBP53539 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOSBP53539 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOSBP53539 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOSBP53539 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOSBP53539 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOSBP53539 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOSBP53539 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FOSBP53539 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOSBP53539 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FOSBP53539 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FOSBP53539 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOSBP53539 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOSBP53539 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOSBP53539 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOSBP53539 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOSBP53539 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOSBP53539 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FOSBP53539 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOSBP53539 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOSBP53539 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOSBP53539 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOSBP53539 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOSBP53539 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOSBP53539 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOSBP53539 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOSBP53539 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOSBP53539 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOSBP53539 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOSBP53539 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOSBP53539 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOSBP53539 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FOSBP53539 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOSBP53539 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOSBP53539 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOSBP53539 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOSBP53539 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOSBP53539 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOSBP53539 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOSBP53539 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOSBP53539 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOSBP53539 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOSBP53539 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOSBP53539 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FOSBP53539 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOSBP53539 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOSBP53539 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOSBP53539 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOSBP53539 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOSBP53539 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms