Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NKX2-5P52952 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms