Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX2P52951 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX2P52951 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX2P52951 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX2P52951 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX2P52951 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX2P52951 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX2P52951 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX2P52951 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX2P52951 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX2P52951 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX2P52951 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX2P52951 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX2P52951 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX2P52951 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX2P52951 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX2P52951 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX2P52951 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX2P52951 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX2P52951 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX2P52951 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX2P52951 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX2P52951 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX2P52951 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX2P52951 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBX2P52951 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBX2P52951 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBX2P52951 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBX2P52951 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBX2P52951 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBX2P52951 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBX2P52951 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBX2P52951 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBX2P52951 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBX2P52951 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBX2P52951 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBX2P52951 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBX2P52951 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBX2P52951 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBX2P52951 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBX2P52951 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBX2P52951 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBX2P52951 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GBX2P52951 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBX2P52951 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBX2P52951 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX2P52951 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX2P52951 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX2P52951 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX2P52951 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX2P52951 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX2P52951 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX2P52951 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX2P52951 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX2P52951 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX2P52951 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX2P52951 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX2P52951 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX2P52951 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX2P52951 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX2P52951 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX2P52951 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX2P52951 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX2P52951 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX2P52951 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX2P52951 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX2P52951 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX2P52951 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX2P52951 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX2P52951 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX2P52951 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX2P52951 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX2P52951 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX2P52951 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX2P52951 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX2P52951 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX2P52951 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GBX2P52951 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GBX2P52951 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBX2P52951 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBX2P52951 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBX2P52951 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBX2P52951 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBX2P52951 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBX2P52951 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GBX2P52951 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GBX2P52951 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBX2P52951 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBX2P52951 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBX2P52951 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBX2P52951 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBX2P52951 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBX2P52951 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GBX2P52951 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms