Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 ZCCHC2-211ENST00000621048 704 ntTSL 326.62■■□□□ 1.856e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 ZCCHC2-202ENST00000585873 5652 ntTSL 1 (best)24.18■■□□□ 1.466e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 CCDC26-202ENST00000520048 904 ntTSL 312.91□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 CCDC26-203ENST00000523151 1496 ntTSL 1 (best)10.01□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 MAGI3-205ENST00000477955 890 ntTSL 37.17□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 RAF1-203ENST00000423275 2354 ntTSL 226.05■■□□□ 1.761e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 RAF1-202ENST00000416093 962 ntTSL 223.66■■□□□ 1.381e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 CHD6-209ENST00000482596 599 ntTSL 1 (best)11.32□□□□□ -0.66e-8■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 CHD6-204ENST00000440647 536 ntTSL 39.38□□□□□ -0.916e-8■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -16e-8■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.026e-8■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 MLLT10-208ENST00000438473 1085 ntTSL 56.35□□□□□ -1.394e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.491e-8■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 AC090360.1-202ENST00000562771 1032 ntAPPRIS P5 TSL 436.87■■■■□ 3.491e-8■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 RBFA-203ENST00000586847 566 ntTSL 436.13■■■■□ 3.371e-8■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.531e-8■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 RBFA-204ENST00000591612 1587 nt30.53■■■□□ 2.481e-8■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.251e-8■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.223e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.883e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 CSNK1D-205ENST00000403276 1040 ntTSL 226.69■■□□□ 1.863e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 217.78■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 DHX15-201ENST00000336812 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.124e-11■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 DHX15-204ENST00000508032 3028 ntTSL 1 (best)5.31□□□□□ -1.564e-11■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 ZNF251-202ENST00000524394 315 ntTSL 525.27■■□□□ 1.644e-15■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.259e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 KIAA0391-204ENST00000557404 789 ntTSL 321.75■■□□□ 1.079e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.914e-15■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.799e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 KIAA0391-205ENST00000603544 2232 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.349e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.729e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.879e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.069e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 IRF2-203ENST00000504340 565 ntTSL 422.65■■□□□ 1.222e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 IRF2-207ENST00000509274 591 ntTSL 422.46■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 IRF2-208ENST00000510814 568 ntTSL 422.12■■□□□ 1.132e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 IRF2-205ENST00000506230 498 ntTSL 220.8■□□□□ 0.922e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 IRF2-209ENST00000512020 731 ntTSL 313.11□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 IRF2-201ENST00000393593 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 IRF2-206ENST00000507523 595 ntTSL 47.03□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 31.3
HNRNPMP52272 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.993e-8■■■■■ 31.2
HNRNPMP52272 ZNF496-202ENST00000461277 3857 ntTSL 1 (best)11.61□□□□□ -0.553e-8■■■■■ 31.2
HNRNPMP52272 ZFAND3-204ENST00000440482 821 ntTSL 320.85■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 31.2
HNRNPMP52272 EHMT1-214ENST00000488242 789 ntTSL 521.46■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 31.2
HNRNPMP52272 EHMT1-213ENST00000486164 781 ntTSL 321.24■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 31.2
HNRNPMP52272 ANKRD13D-209ENST00000508417 2009 ntTSL 224.76■■□□□ 1.555e-14■■■■■ 31.2
HNRNPMP52272 ANKRD13D-213ENST00000512231 2768 ntTSL 219.23■□□□□ 0.675e-14■■■■■ 31.2
HNRNPMP52272 AKT1-205ENST00000553506 2830 ntTSL 227.83■■■□□ 2.053e-7■■■■■ 31.2
HNRNPMP52272 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.636e-7■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 AC026412.1-205ENST00000522848 1130 ntTSL 233.94■■■■□ 3.029e-7■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.559e-7■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 AC026412.1-204ENST00000507505 1009 ntTSL 1 (best)25.52■■□□□ 1.689e-7■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.239e-7■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.079e-7■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC20.44■□□□□ 0.869e-7■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.92e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 RPL32-201ENST00000273223 567 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 RPL32-204ENST00000429711 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 RPL32-203ENST00000396957 1749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 RPL32-208ENST00000457131 555 ntTSL 29.13□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 DLG1-214ENST00000447466 858 ntTSL 1 (best)9.99□□□□□ -0.815e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.015e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.335e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 HERC4-207ENST00000460168 2215 ntTSL 215.09■□□□□ 0.018e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.698e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 HERC4-209ENST00000473533 3593 ntTSL 1 (best)7.96□□□□□ -1.148e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 HERC4-206ENST00000427635 6391 ntTSL 26.98□□□□□ -1.298e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.518e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.668e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.838e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 AL359736.1-201ENST00000382141 4157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 SPATA13-206ENST00000424834 8603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.471e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.881e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.841e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 RAB7A-207ENST00000491681 552 ntTSL 27.15□□□□□ -1.261e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 ZNF148-204ENST00000471196 566 ntTSL 430.63■■■□□ 2.491e-6■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.716e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 ERBIN-206ENST00000503913 544 ntTSL 37.05□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.536e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.676e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.726e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.726e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.736e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.872e-6■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 ERBIN-215ENST00000511671 589 ntTSL 33.17□□□□□ -1.92e-6■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.936e-8■■■■■ 31.1
HNRNPMP52272 ARID1B-218ENST00000636748 8853 ntTSL 211.35□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 31
HNRNPMP52272 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.115e-7■■■■■ 31
HNRNPMP52272 ADAM10-203ENST00000402627 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 31
HNRNPMP52272 ADAM10-201ENST00000260408 11431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 31
HNRNPMP52272 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.737e-7■■■■■ 31
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 133.7 ms